На мой взгляд, коммерческих проектов пострадает немного. Конечно же, «несправедливо обиженные» будут, но это временное явление.
Если говорить о порталах/сайтах развлечений и им подобным (где чаще всего встречается данное явление), то, скорее всего, пострадают почти все :) (если не успеют быстро устранить «проблему»).
Наша позиция – шаг Яндекса в этом направлении полностью поддерживаем и надеемся, что они пойдут намного дальше. Любой обман/спам должен быть наказан. Многие вебмастера/владельцы сайтов с обманными pop-up элементами будут кричать: «Нас лишают заработка» и в сторону Яндекса будет «-1». С нашей же стороны (со стороны пользователей) Яндексу «+1»!»